Красноярский автотранспортный техникум был организован Приказом Министерства автомобильного транспорта и шоссейных дорог РСФСР № 164 от 07.05.1965 г. на основании Постановления Совета Министров РСФСР от 05.06.1961г. № 696 с названием «Красноярский автомобильно-дорожный техникум», на базе учебно-консультационного пункта Свердловского Автодорожного техникума.Приказом Министерства автомобильного транспорта РСФСР № 128-У от 29.04.1971 г. техникуму присвоено новое громкое и красивое название «Красноярский автотранспортный техникум».
Приказом Министерства транспорта РФ № 160 от 30.11.2001 г. переименован в ГОУ СПО «Красноярский автотранспортный техникум».
Приказом Министерства транспорта РФ № 108 от 26.11.2004 г. переименован в ФГОУ СПО «Красноярский автотранспортный техникум».
Приказом Министерства образования и науки РФ № 1413 от 17.11.2005 г. принят в ведение Федерального агентства образования.
На основании распоряжения Правительства РФ от 29.12.2011 г. N 2413-р «О передаче субъектам Российской Федерации федеральных государственных образовательных учреждений среднего профессионального образования» ФГОУ СПО «Красноярский автотранспортный техникум» передан в Красноярский край.
В соответствии с приказом Министерства образования и науки Красноярского края от 29.01.2012г. №12-03/1 Федеральное государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Красноярский автотранспортный техникум» переименован в краевое государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования (среднее специальное учебное заведение) «Красноярский автотранспортный техникум».
Распоряжением Правительства Красноярского края от 19.01.2012г. № 25-р Учредителем Красноярского автотранспортного техникума является Министерство образования и науки Красноярского края.
Согласно распоряжения Правительства Красноярского края от 18 июля 2014 года № 472-р краевое государственное бюджетное образовательное учреждение среднего профессионального образования (среднее специальное учебное заведение) «Красноярский автотранспортный техникум» реорганизован путем присоединения к нему краевого государственного бюджетного образовательного учреждения начального профессионального образования «Профессиональное училище № 50». Наименование учреждения после процесса реорганизации считать краевое государственное бюджетное профессиональное образовательное учреждение "Красноярский автотранспортный техникум".
КГБПОУ "Красноярский автотранспортный техникум" ведет подготовку студентов по следующим специальностям:
Специальность 23.02.07 “Техническое обслуживание и ремонт двигателей, систем и агрегатов автомобилей”. Квалификация выпускника - техник.
Специальность 23.02.01 “Организация перевозок и управление на транспорте (автомобильном)”. Квалификация выпускника - техник.
Специальность 23.01.06 «Машинист дорожных и строительных машин».
Квалификация выпускника - машинист дорожных и строительных машин.
Специальность 23.01.07 «Машинист крана автомобильного (крановщик)».
Квалификация выпускника - машинист крана автомобильного (крановщик).
